MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidothermus cellulolyticus 11B chromosome

Total Repeats: 58113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008578	GAG	2	6	21460	21465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927232
502	NC_008578	CGG	2	6	21509	21514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927232
503	NC_008578	GATG	2	8	21627	21634	25 %	25 %	50 %	0 %	117927232
504	NC_008578	AGC	2	6	21656	21661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
505	NC_008578	GCA	2	6	21672	21677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
506	NC_008578	CGA	2	6	21798	21803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
507	NC_008578	GCG	2	6	21812	21817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927232
508	NC_008578	GAT	2	6	21823	21828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927232
509	NC_008578	GAG	2	6	21835	21840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927232
510	NC_008578	CGC	2	6	21858	21863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927232
511	NC_008578	GCGG	2	8	21882	21889	0 %	0 %	75 %	25 %	117927232
512	NC_008578	GCA	2	6	21897	21902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
513	NC_008578	GCG	2	6	21980	21985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927233
514	NC_008578	GCT	2	6	22016	22021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
515	NC_008578	CGA	2	6	22022	22027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927233
516	NC_008578	TCCGC	2	10	22028	22037	0 %	20 %	20 %	60 %	117927233
517	NC_008578	GTC	2	6	22114	22119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
518	NC_008578	GGA	2	6	22131	22136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927233
519	NC_008578	ACG	4	12	22177	22188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927233
520	NC_008578	ACC	2	6	22226	22231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117927233
521	NC_008578	CCG	2	6	22237	22242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927233
522	NC_008578	GCG	2	6	22249	22254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927233
523	NC_008578	GAT	2	6	22263	22268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927233
524	NC_008578	CCG	2	6	22299	22304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927233
525	NC_008578	TCG	2	6	22315	22320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
526	NC_008578	ACG	2	6	22321	22326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927233
527	NC_008578	ACGA	2	8	22336	22343	50 %	0 %	25 %	25 %	117927233
528	NC_008578	GCC	2	6	22346	22351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927233
529	NC_008578	GCC	3	9	22363	22371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927233
530	NC_008578	TGG	2	6	22400	22405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927233
531	NC_008578	CGT	2	6	22407	22412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
532	NC_008578	GCC	2	6	22428	22433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927233
533	NC_008578	GAT	2	6	22434	22439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927233
534	NC_008578	TCG	2	6	22468	22473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
535	NC_008578	ACG	2	6	22474	22479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927233
536	NC_008578	CGG	2	6	22544	22549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927233
537	NC_008578	TCG	2	6	22552	22557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
538	NC_008578	GAC	2	6	22599	22604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927233
539	NC_008578	CGT	2	6	22676	22681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
540	NC_008578	GAA	2	6	22703	22708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117927233
541	NC_008578	TCG	2	6	22744	22749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
542	NC_008578	TCG	2	6	22759	22764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
543	NC_008578	TG	3	6	22801	22806	0 %	50 %	50 %	0 %	117927233
544	NC_008578	GTG	2	6	22894	22899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927233
545	NC_008578	CGCC	2	8	22953	22960	0 %	0 %	25 %	75 %	117927233
546	NC_008578	CAG	2	6	22991	22996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927233
547	NC_008578	TCG	2	6	23008	23013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
548	NC_008578	GCG	2	6	23015	23020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927233
549	NC_008578	CGG	2	6	23057	23062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927233
550	NC_008578	CCCA	2	8	23067	23074	25 %	0 %	0 %	75 %	117927233
551	NC_008578	CGG	2	6	23234	23239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927234
552	NC_008578	TCG	2	6	23331	23336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927234
553	NC_008578	TCC	2	6	23345	23350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117927234
554	NC_008578	CG	3	6	23367	23372	0 %	0 %	50 %	50 %	117927234
555	NC_008578	CG	3	6	23381	23386	0 %	0 %	50 %	50 %	117927234
556	NC_008578	TCG	2	6	23405	23410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927234
557	NC_008578	CGCC	2	8	23434	23441	0 %	0 %	25 %	75 %	117927234
558	NC_008578	CGT	2	6	23455	23460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927234
559	NC_008578	GC	4	8	23512	23519	0 %	0 %	50 %	50 %	117927234
560	NC_008578	CTG	2	6	23533	23538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927234
561	NC_008578	TCG	2	6	23539	23544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927234
562	NC_008578	GAT	2	6	23623	23628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927234
563	NC_008578	GT	3	6	23726	23731	0 %	50 %	50 %	0 %	117927235
564	NC_008578	AGG	2	6	23740	23745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927235
565	NC_008578	GCG	2	6	23780	23785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
566	NC_008578	GTTG	2	8	23820	23827	0 %	50 %	50 %	0 %	117927235
567	NC_008578	GGTC	2	8	23834	23841	0 %	25 %	50 %	25 %	117927235
568	NC_008578	G	6	6	23848	23853	0 %	0 %	100 %	0 %	117927235
569	NC_008578	CGG	2	6	23881	23886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
570	NC_008578	GAC	2	6	23940	23945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927235
571	NC_008578	GAT	2	6	23991	23996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927235
572	NC_008578	GCCG	2	8	23999	24006	0 %	0 %	50 %	50 %	117927235
573	NC_008578	GGC	2	6	24021	24026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
574	NC_008578	CGGC	2	8	24032	24039	0 %	0 %	50 %	50 %	117927235
575	NC_008578	CGG	2	6	24062	24067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
576	NC_008578	CGG	3	9	24111	24119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
577	NC_008578	CTG	2	6	24134	24139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927235
578	NC_008578	CGG	2	6	24170	24175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
579	NC_008578	CGA	2	6	24176	24181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927235
580	NC_008578	ACG	2	6	24215	24220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927235
581	NC_008578	CGA	2	6	24251	24256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927235
582	NC_008578	GCT	2	6	24266	24271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927235
583	NC_008578	GCGG	2	8	24314	24321	0 %	0 %	75 %	25 %	117927235
584	NC_008578	CGTGGT	2	12	24341	24352	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	117927235
585	NC_008578	GGC	2	6	24408	24413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
586	NC_008578	CGC	2	6	24438	24443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927235
587	NC_008578	CG	5	10	24477	24486	0 %	0 %	50 %	50 %	117927235
588	NC_008578	GACCA	2	10	24498	24507	40 %	0 %	20 %	40 %	117927235
589	NC_008578	GTG	2	6	24830	24835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927236
590	NC_008578	CCG	2	6	24836	24841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927236
591	NC_008578	GAG	2	6	24874	24879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927236
592	NC_008578	GTC	2	6	24901	24906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927236
593	NC_008578	CTG	2	6	24928	24933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927236
594	NC_008578	GAT	2	6	24946	24951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927236
595	NC_008578	GAC	2	6	24952	24957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927236
596	NC_008578	GTC	2	6	24970	24975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927236
597	NC_008578	GGT	2	6	25020	25025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927236
598	NC_008578	CGGC	2	8	25037	25044	0 %	0 %	50 %	50 %	117927236
599	NC_008578	GCCCG	2	10	25071	25080	0 %	0 %	40 %	60 %	117927236
600	NC_008578	GAT	2	6	25090	25095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927236
601	NC_008578	TTG	2	6	25144	25149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117927236
602	NC_008578	CAG	2	6	25246	25251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927236
603	NC_008578	GCG	2	6	25266	25271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927236
604	NC_008578	CA	3	6	25312	25317	50 %	0 %	0 %	50 %	117927236
605	NC_008578	TGG	2	6	25337	25342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927236
606	NC_008578	GTT	2	6	25381	25386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117927236
607	NC_008578	GGT	2	6	25399	25404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927236
608	NC_008578	CGT	2	6	25428	25433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927236
609	NC_008578	AGG	2	6	25445	25450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927236
610	NC_008578	GAT	2	6	25522	25527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927236
611	NC_008578	GTT	2	6	25531	25536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117927236
612	NC_008578	CCT	2	6	25539	25544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117927236
613	NC_008578	CGA	2	6	25572	25577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927236
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615	NC_008578	ACG	3	9	25602	25610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927236
616	NC_008578	CGG	2	6	25611	25616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927236
617	NC_008578	CGA	2	6	25659	25664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927236
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619	NC_008578	GTT	2	6	25675	25680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117927236
620	NC_008578	CGA	2	6	25773	25778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927236
621	NC_008578	GTC	2	6	25784	25789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927236
622	NC_008578	CGC	2	6	25821	25826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927236
623	NC_008578	GAT	2	6	25828	25833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927236
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